<<
>>
代谢组学 蛋白代谢差异表达聚类热图 13836 查看 热图（英语：heat map/heatmap）在二维空间中以颜色的形式显示一个现象的绝对量，是一种数据可视化技术。 为了更直观的展示样本之间的关系及代谢物或者蛋白在不同样本之间的表达差异，对所有显著差异蛋白或者代谢物和按照VIP排序前50的显著差异蛋白或代谢物的表达量分别进行层次聚类 多元统计分析 12265 查看 多元变量统计分析（Multivariate Statistical Analysis），简称多元变量分析，又称多元统计分析，为统计学的一支，常用于管理科学、社会科学和生命科学等领域。 多元统计分析将先采用无监督的主成分分析（PCA）来观察各样本之间的总体分布和整个分析过程的稳定性，然后用有监督的偏最小二乘法分析（PLS-DA）及正交偏最小二乘法分析（OPLS-DA）来区分各组间特征轮廓的总体差异，找到组间的特征差异物质。 蛋白代谢功能富集分析-2023版 10486 查看 该工具针对于蛋白和代谢差异数据进行的功能富集分析，包括GO、KEGG、Reactome、InterPro、PPI_network和Wikipathways。 蛋白代谢火山图 8599 查看 火山图（Volcano plot）是散点图的一种，它将统计测试中的统计显著性量度（如p-value）和变化幅度（如Fold change）相结合，从而能够帮助快速直观地识别那些变化幅度较大且具有统计学意义的数据点（代谢物等）。其中红色原点代表在实验组中显著上调的差异代谢产物/差异蛋白，蓝色原点代表显著下调的差异代谢产物/差异蛋白，灰色点代表不显著的差异代谢产物/差异蛋白。 代谢项目分析-2023版 7217 查看 代谢组学流程包括：数据预处理、功能代谢组学分析、统计分析、差异比较分析以及通路富集分析等。 蛋白代谢箱线图 3188 查看 箱形图（boxplot），又称为盒须图、盒式图、盒状图或箱线图，是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图。因图形如箱子，且在上下四分位数之外常有线条像胡须延伸出去而得名。 本工具使用pairwise.t.test 方法，显示每一个蛋白或代谢物质在组间的显著性差异。适用于组别为2组及以上，组内有生物学重复的数据集。 蛋白代谢Venn图 3031 查看 Venn图：分析展示两组或两组以上差异比较组的共有和特有差异代谢物。 蛋白代谢富集气泡图 2777 查看 气泡图（bubble chart）是可用于展示三个变量之间的关系。 蛋白代谢气泡图可使用GO、KEGG、InterPro、Reactome和WikiPathway富集数据，用于展示Enrichment Score（富集分值），Count（通路包含的差异蛋白/差异代谢物数目），富集pvalue值。 蛋白代谢富集柱状图 2438 查看 条形图（bar chart/bar graph），又称为长条图、 柱状图、棒形图 富集柱状图：显示根据P-value 排序后最小的20个条目绘制 蛋白代谢ROC曲线 2081 查看 在信号检测理论中，接收者操作特征曲线，或者叫ROC曲线（Receiver operating characteristic curve，简称ROC曲线），是一种坐标图式的分析工具，用于选择最佳的信号侦测模型、舍弃次佳的模型或者在同一模型中设置最佳阈值。 蛋白代谢GSEA分析 1955 查看 基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis， GSEA） 是一种用于确定一组预先定义的基因是否在两种生物状态（例如表型）之间显示出统计上显著的或一致的差异的计算方法。其分为三个步骤，分别为计算富集分数、估计富集分数显著性水平和矫正多重假设验证。 GESA常使用两大基因集合数据库： （1）GO：Gene Ontology(GO)数据库提供了专业的术语来定义基因产物的属性。它包含三大类：生物学过程（Biological Process，BP）；细胞组分（Cellular Component，CC）；分子功能（Molecular Function，MF） （2）KEGG：Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的数据库。GSEA也支持自定义基因集合，例如miRNA靶标关系对集合 棒棒糖图 1838 查看 Lollipop Chart（棒棒糖图）： 根据差异蛋白或者代谢物的VIP选定top10，通过Lolipopmap图直观的展示代谢物或者蛋白的上下调信息及其log2（FoldChange）值。
在线咨询