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代谢组学
多元统计分析
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多元变量统计分析（Multivariate Statistical Analysis），简称多元变量分析，又称多元统计分析，为统计学的一支，常用于管理科学、社会科学和生命科学等领域。 多元统计分析将先采用无监督的主成分分析（PCA）来观察各样本之间的总体分布和整个分析过程的稳定性，然后用有监督的偏最小二乘法分析（PLS-DA）及正交偏最小二乘法分析（OPLS-DA）来区分各组间特征轮廓的总体差异，找到组间的特征差异物质。
蛋白代谢功能富集分析-2023版
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该工具针对于蛋白和代谢差异数据进行的功能富集分析，包括GO、KEGG、Reactome、InterPro、PPI_network和Wikipathways。
代谢项目分析
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代谢组学流程包括：数据预处理、功能代谢组学分析、统计分析、差异比较分析以及通路富集分析等。
蛋白代谢GSEA分析
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基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis， GSEA） 是一种用于确定一组预先定义的基因是否在两种生物状态（例如表型）之间显示出统计上显著的或一致的差异的计算方法。其分为三个步骤，分别为计算富集分数、估计富集分数显著性水平和矫正多重假设验证。 GESA常使用两大基因集合数据库： （1）GO：Gene Ontology(GO)数据库提供了专业的术语来定义基因产物的属性。它包含三大类：生物学过程（Biological Process，BP）；细胞组分（Cellular Component，CC）；分子功能（Molecular Function，MF） （2）KEGG：Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)是系统分析基因功能，联系基因组信息和功能信息的数据库。GSEA也支持自定义基因集合，例如miRNA靶标关系对集合
棒棒糖图
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Lollipop Chart（棒棒糖图）： 根据差异蛋白或者代谢物的VIP选定top10，通过Lolipopmap图直观的展示代谢物或者蛋白的上下调信息及其log2（FoldChange）值。
蛋白代谢时间序列趋势分析
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趋势分析：分析展示具有时间序列特征的蛋白质组或代谢组数据中蛋白或代谢物表达的时间趋势，并将具有相似表达模式的蛋白或代谢物聚类
分类饼图
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直观的展示代谢物的分类情况，分别对Class、Super Class及Sub Class绘制饼图
脂质绘图-分类气泡图
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气泡图（bubble chart）是可用于展示三个变量之间的关系。 脂质分类气泡图，同Class分类下的不同SubClas分类的脂质代谢物的表达分布
热图气泡图组合
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本工具用于绘制差异/富集分析结果的热图-气泡图组合图。
饼图
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饼图（Pie Chart）是一种圆形的统计图表，能够直观地展示一个总体数据由哪些部分构成，以及各部分所占的比例。
富集和弦图
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富集和弦图是circos图的一种，本工具绘制富集和弦图，用于展示转录/代谢/蛋白组功能和基因/代谢物/蛋白关系。
普氏分析
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普氏分析（Procrustes Analysis），又称普鲁克分析，是一种形态分布的分析方法，主要用于展示相同个体不同组学的数据关联程度，也可以用于不同表型数据之间相似性/相异性的分析。 可分析微生物菌群与临床因子（如代谢组数据）整体之间的相关性，从而揭示疾病发生发展过程中代谢物变化与微生物变化是否具有一致性。
