Venn图

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开发者：stx  |  更新于3 月，4 周前  |  浏览量 9199

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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Venn图，又称韦恩图或文氏图，是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。
Venn图在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的基因、OTU和分类单元等。

参数信息
  1. venn图输入文件，可以参考使用方法一和方法二准备venn输入文件

查看更多非必选参数

  1. 仅允许使用方法二中的文件类型
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  4. 仅允许使用方法二中的文件类型
    保存交集/并集或者每个区域单独的结果
相关数据
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    1. 1. 方法一（单表格输入）

        每列数据为一个数据集，包含不同数量的基因（如下示例可以通过Venn分析工具展示A，B，C这3个数据集之间的关系。）


    输入数据样式.png



        demo数据下载：Venn_data1.xls（将该文件提交到本工具的输入文件1中，点击提交按钮即可生成这3组数据venn图结果。）


    1. 2. 方法二（多表格输入）

    1.     (1)每个表格表示一个集合

    2.     (2)表格第一列信息作为该表格的元素的集合，且不可重复（如探针，转录本，基因名称，名称需提前去重，重复会导致运行错误）


    图片.png


        demo数据下载：comp1.xlsx  comp2.xlsx  comp3.xlsx


    1. 3.保存结果类型

        默认保存venn交集结果信息，也可选“并集”或“每个区域均保存”，“每个区域均保存”即导出venn图上每个数字对应元素集合表格。


    1. 1. venn图 

          示例图中一个圈表示一个集合，其中的数字表示各区域交集元素数量。

                       

    venn图.jpg


    1. (1) 根据输入数据的不同，可以设置为单文件的venn分析作图（参考使用方法一）和多文件的venn分析作图（参考使用方法二）；

    2. (2) venn图仅支持低于5个集合绘图，超过5个集合请使用upset绘图工；

  • 版本更新日期更新内容
    1.2 2020.9.1移除upset图
    1.3 2020.10.27添加每个区域说明图
    1.3.12021.01.07修复表格存在INF无法运行


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