Venn图

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Venn图,又称韦恩图或文氏图,是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。 Venn图在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的基因、OTU和分类单元等。

参数调整

venn图输入文件,可以参考使用方法一和方法二准备venn输入文件
设置每个圈的颜色透明度,透明度范围为0-1,可为小数
保存交集/并集或者每个区域单独的结果
为所有的圈选择配色方案
venn图圈内的字体的大小
venn图圈内的字体类型
图例的字体大小
图例的字体类型
仅允许使用方法二中的文件类型
仅允许使用方法二中的文件类型
仅允许使用方法二中的文件类型
仅允许使用方法二中的文件类型
提交 重置

结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. 方法一(单表格输入)

    每列数据为一个数据集,包含不同数量的基因(如下示例可以通过Venn分析工具展示A,B,C这3个数据集之间的关系。)


输入数据样式.png



    demo数据下载Venn_data1.xls(将该文件提交到本工具的输入文件1中,点击提交按钮即可生成这3组数据venn图结果。)


  1. 2. 方法二(多表格输入)

  1.     (1)每个表格表示一个集合

  2.     (2)表格第一列信息作为该表格的元素的集合,且不可重复(如探针,转录本,基因名称,名称需提前去重,重复会导致运行错误


图片.png


    demo数据下载comp1.xlsx  comp2.xlsx  comp3.xlsx


    3.保存结果类型

    默认保存venn交集结果信息,也可选“并集”或“每个区域均保存”,“每个区域均保存”即导出venn图上每个数字对应元素集合表格。


    4.圈着色配色方案:

image.png


  1. 1. venn图 

      示例图中一个圈表示一个集合,其中的数字表示各区域交集元素数量。

                   

venn图.jpg






  1. (1) 根据输入数据的不同,可以设置为单文件的venn分析作图(参考使用方法一)和多文件的venn分析作图(参考使用方法二);

  2. (2) venn图仅支持低于5个集合绘图,超过5个集合请使用upset绘图工;

版本更新日期更新内容
1.2 2020.9.1移除upset图
1.3 2020.10.27添加每个区域说明图
1.3.12021.01.07修复表格存在INF无法运行
2.222021.02.09增加字体大小、图例大小、颜色透明度、圈着色方案参数


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