文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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Venn图,又称韦恩图或文氏图,是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。
Venn图在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的基因、OTU和分类单元等。
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程序运行出错,报错信息如下:
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1. 方法一(单表格输入)
每列数据为一个数据集,包含不同数量的基因(如下示例可以通过Venn分析工具展示A,B,C这3个数据集之间的关系。)
demo数据下载:Venn_data1.xlsx
(将该文件提交到本工具的输入文件1中,点击提交按钮即可生成这3组数据venn图结果。)
2. 方法二(多表格输入)
(1)每个表格表示一个集合
(2)表格第一列信息作为该表格的元素的集合,且不可重复(如探针,转录本,基因名称,名称需提前去重,重复会导致运行错误)
demo数据下载:comp1.xlsx
comp2.xlsx
comp3.xlsx
3.保存结果类型
默认保存venn交集结果信息,也可选“并集”或“每个区域均保存”,“每个区域均保存”即导出venn图上每个数字对应元素集合表格。
4.圈着色配色方案:
1. venn图
示例图中一个圈表示一个集合,其中的数字表示各区域交集元素数量。
(1) 根据输入数据的不同,可以设置为单文件的venn分析作图(参考使用方法一)和多文件的venn分析作图(参考使用方法二);
(2) venn图仅支持低于5个集合绘图,超过5个集合请使用upset绘图工;
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
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1.2 | 2020.9.1 | 移除upset图 |
1.3 | 2020.10.27 | 添加每个区域说明图 |
1.3.1 | 2021.01.07 | 修复表格存在INF无法运行 |
2.22 | 2021.02.09 | 增加字体大小、图例大小、颜色透明度、圈着色方案参数 |