Venn图

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开发者:stx  |  更新于1 月,3 周前  |  浏览量 7143

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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Venn图,又称韦恩图或文氏图,是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。
Venn图在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的基因、OTU和分类单元等。

参数信息
  1. venn图输入文件,可以参考使用方法一和方法二准备venn输入文件

查看更多非必选参数

  1. 仅允许使用方法二中的文件类型
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    保存交集/并集或者每个区域单独的结果
相关数据
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    1. 1. 方法一(单表格输入)

        每列数据为一个数据集,包含不同数量的基因(如下示例可以通过Venn分析工具展示A,B,C这3个数据集之间的关系。)


    输入数据样式.png



        demo数据下载Venn_data1.xls(将该文件提交到本工具的输入文件1中,点击提交按钮即可生成这3组数据venn图结果。)


    1. 2. 方法二(多表格输入)

    1.     (1)每个表格表示一个集合

    2.     (2)表格第一列信息作为该表格的元素的集合,且不可重复(如探针,转录本,基因名称,名称需提前去重,重复会导致运行错误


    图片.png


        demo数据下载comp1.xlsx  comp2.xlsx  comp3.xlsx


    1. 3.保存结果类型

        默认保存venn交集结果信息,也可选“并集”或“每个区域均保存”,“每个区域均保存”即导出venn图上每个数字对应元素集合表格。


    1. 1. venn图 

          示例图中一个圈表示一个集合,其中的数字表示各区域交集元素数量。

                       

    venn图.jpg


    1. (1) 根据输入数据的不同,可以设置为单文件的venn分析作图(参考使用方法一)和多文件的venn分析作图(参考使用方法二);

    2. (2) venn图仅支持低于5个集合绘图,超过5个集合请使用upset绘图工;

  • 版本更新日期更新内容
    1.2 2020.9.1移除upset图
    1.3 2020.10.27添加每个区域说明图
    1.3.12021.01.07修复表格存在INF无法运行


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