组内合并Venn

开发者:wangyueli  |  更新于1 月前  |  浏览量 173

Venn图,又称韦恩图或文氏图,是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。Venn图在生物信息学领域常用于展示样品不同分组间共有和特有的基因、OTU和分类单元等。

本工具用于组内生物学重复合并做Venn分析,适用于适用于组别为5组及以下数据集。

本例子为OTU丰度组内合并做Venn图,可以选择剔除部分样本,合并后的数据集名为原来的组名,合并算法为组内取平均。

参数信息
  1. OTU丰度文件,第一列为OTU id,其余各列为各样本中相应OTU丰度。
  2. 样本分组信息文件,第一列为样本分析名,与OTU丰度文件中的样本分析名一致,第二列为分组名,需要的剔除的样本不需要填写分组名。
相关数据
  • 说明文档
  • 结果说明
  • 版本信息
  • 1. OTU丰度示例文件

        OTU丰度文件,第一列为OTU id,其余各列为各样本中相应OTU丰度。

    OTUs.png

        示例文件:OTUs.xls


    2. 样本分组信息示例文件

        样本分组信息文件,第一列为样本分析名,与OTU丰度文件中的样本分析名一致,第二列为分组名,需要的剔除的样本不需要填写分组名。

    mapping.png

        示例文件:mapping.xls


  • 1. OTU组内合并Venn图

        三种颜色线构成的圈中数字1141代表A,B和C三组共有的OTU个数;蓝色和绿色线构成的圈中数字187代表A和B共有的OTU个数;42代表A组特有的OTU个数。

    venn.png

  • 版本
    使用说明
    版本信息
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档