文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为绘制累计柱状图,柱状图是一种以矩形的长度(高度)为变量的统计图表,只包含一个变量,从形式上又可以划分为累计柱状图和躲避式柱状图等不同类型。 我们以物种在样本中所占的比例作为变量,横坐标为样本,以累计柱状图的方式展现每个样本中各物种的比例。如果提供了样本分组信息,还可以通过组内求平均的方式展现每个分组的物种比例。
工具预估运行时间为 {{ run_time }} 秒
程序运行出错,报错信息如下:
请检查数据文件格式后重新提交运行
本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!
1. 物种相对丰度文件
第一列为物种名,随后为样本分析名,各列对应值为物种在样本中的相对丰度(支持txt、xls、xlsx格式)。
demo数据下载:others_Top15_genus.xls
2. 样本分组信息文件(非必须,需要以组别展示时需要此文件,否则以样本展示)
第一列为样本分析名,第二列为样本的分组名称。如果需要进行样本分组分析,则需要填此参数;如果无需进行样本分组分析,则无需填此参数(支持txt、xls、xlsx格式)。
demo数据下载:mapping.xls
1. 结果示意图
该图展示了不分组情况下所有样本内的物种比例情况。横坐标为样本分析名,纵坐标为不同物种在样本中所占的比例。不同物种用不同颜色区分,右侧为物种的注释信息。
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
---|---|---|
v1.1 | 2020.10.25 | 更新说明文档 |
v2.7 | 2021.04.23 | 删除Rplots.pdf |
v2.8 | 2021.05.12 | 修改纵坐标刻度 |
v3.6 | 2021.06.29 | debug 下标出界问题,check mapping.txt 与输入文件样本分析名的一致性,去除type参数 |
v4.0 | 2022.3.2 | 增加坐标轴字体大小调整 |