STRING蛋白互作
文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具关联STRING数据库，对基因绘制 Protein-Protein 互作网络图。
参数调整
结果与说明
工具预估运行时间为 {{ run_time }} 秒
程序运行出错，报错信息如下：
请检查数据文件格式后重新提交运行
本次分析未能正常生成结果文件，请核对输入信息或者参考使用说明进行使用！
1. 输入文件
示例文件为基因列表文件，需包含列名 gene_id (基因/蛋白) ；差异基因列表可添加列名 Regulation 和 FoldChange。
demo数据下载：
gene_list.xls
demo数据下载：gene_list_with_FC.xls
1. 图形输出
根据 Top 值，筛选对应数目的基因进行蛋白互作分析，并绘制 Protein-Protein 互作网络图，输出3种文件格式，svg,pdf,png。
2. 文件输出
使用输入基因列表中的所有基因进行蛋白互作分析，并输出所有关系对结果文件。
结果表头解释
| 表头 | 解释 |
| stringId_A | 基因A的stringId |
| stringId_B | 基因B的stringId |
| preferredName_A | A基因名 |
| preferredName_B | B基因名 |
| ncbiTaxonId | NCBI的物种分类标识符 |
| score | 结合不同渠道证据的概率矫正后的综合得分 |
| nscore | 邻近得分（从基因间核苷酸计数计算） |
| fscore | 融合得分（来自其他物种的融合蛋白质） |
| pscore | 系统谱系的共存得分（源自相似的基因缺失/存在模式） |
| ascore | 共表达得分（源自由DNA阵列和类似技术测量相似的mRNA表达模式） |
| escore | 实验得分（来自实验数据，如亲和色谱） |
| dscore | 数据库得分（派生自各种数据库的精选数据） |
| tscore | 文本挖掘得分（源自摘要中同时存在的基因/蛋白质名称） |
根据 Top 值，筛选对应数目的基因进行蛋白互作分析，并输出关系对结果文件，可导入 Cytoscape 软件进行编辑。
| 版本 | 更新日期 | 更新内容 |
|---|---|---|
| v1.0.0 | 2021.11.16 | 上线STRING蛋白互作工具 |
| v1.0.1 | 2021.11.23 | 安装xlrd |
| v1.0.2 | 2021.11.25 | 安装openpyxl |