fq序列转fa序列

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具为fastq序列转换成fasta序列。
输出文件名以输入文件夹决定,输出文件后缀为.fasta。

参数调整

输入文件为fastq格式,文件大小不能超过200M
对结果进行命名用于区分不同的任务,默认为当前工具名称_当前日期时间
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结果与说明

任务正在排队中,目前后台任务排队数量:

当前任务开始运行后预计需要耗时

请勿重复提交任务!

程序正在运行中,预计需要耗时

{{ m.content }}

程序运行出错,报错信息如下:

1. fastq文件中每个序列通常有四行

(1)第一行:必须以字符“@”开头,后面跟随唯一的序列ID标识符和可选的序列描述内容,标识符与描述内容用空格分开;

(2)第二行:核酸或氨基酸序列字符;

(3)第三行:必须以字符“+”开头,后面是序列标识符和可选的描述信息;

(4)第四行:碱基质量信息,和第二行的序列相对应,每一个序列都有一个质量评分,根据评分体系的不同,每个字符的含义表示的数字也不相同。


fq.png


    demo数据下载:demo.fastq


  1. 2. fasta文件以序列表示,以序列作为一个基本单元,各行记录信息如下:

  1. (1)第一行:由大于号“>”开头的任意文字说明,用于序列标记,为了区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;

  2. (2)第二行:为序列本身,只允许使用既定的核苷酸或氨基酸编码符号。


out_fa.png


    demo结果下载:demo.fasta


(1) 输入序列文件必须为fasta格式文件;

版本
更新日期版本信息
v1.1
2020.10.25
更新说明文档


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