文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具为fastq序列转换成fasta序列。
输出文件名以输入文件夹决定,输出文件后缀为.fasta。
任务正在排队中,目前后台任务排队数量:
当前任务开始运行后预计需要耗时
请勿重复提交任务!程序正在运行中,预计需要耗时
程序运行出错,报错信息如下:
1. fastq文件中每个序列通常有四行
(1)第一行:必须以字符“@”开头,后面跟随唯一的序列ID标识符和可选的序列描述内容,标识符与描述内容用空格分开;
(2)第二行:核酸或氨基酸序列字符;
(3)第三行:必须以字符“+”开头,后面是序列标识符和可选的描述信息;
(4)第四行:碱基质量信息,和第二行的序列相对应,每一个序列都有一个质量评分,根据评分体系的不同,每个字符的含义表示的数字也不相同。
demo数据下载:demo.fastq
2. fasta文件以序列表示,以序列作为一个基本单元,各行记录信息如下:
(1)第一行:由大于号“>”开头的任意文字说明,用于序列标记,为了区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;
(2)第二行:为序列本身,只允许使用既定的核苷酸或氨基酸编码符号。
demo结果下载:demo.fasta
(1) 输入序列文件必须为fasta格式文件;
版本 | 更新日期 | 版本信息 |
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v1.1 | 2020.10.25 | 更新说明文档 |