fasta序列转化

开发者：华楠, 张婷  |  更新于2 周，6 日前  |  浏览量 195

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具为fasta序列转化，可将fasta序列转化成以下形式：互补序列，反向序列，反向互补序列，转录序列，反转录序列以及翻译的蛋白序列；

输出文件名由输入文件名和转化类型决定，并以.fasta为后缀。

参数信息
  1. 文件大小不能超过200M
相关数据
  • 使用说明
  • 结果说明
  • 版本信息

    1. 1. fasta文件格式

    1. (1)  第一行是由“>”开始的任意文字说明，用于序列标记，为了确保后续分析软件能够区分每条序列，单个序列的标识必须具有唯一性；

    2. (2)  第二行是碱基ATCG/ATCU序列，核苷酸符号大小写均可。


    demo_fa.png


        demo数据下载：demo.fasta


    1. 1. 输出fasta序列文件

    1.     (1) 参数为“互补”时，输出序列文件的碱基互补序列；

    2.     (2) 参数为“反向”时，输出序列文件的反向序列；

    3.     (3) 参数为“反向互补”时，输出序列文件的反向碱基互补序列；

    4.     (4) 参数为“转录”时，输出序列文件的转录序列；

    5.     (5) 参数为“反转录”时，输出序列文件的逆转录序列；

    6.     (6) 参数为“翻译”时，输出序列文件的翻译序列。


    output_fa.png


    示例文件：demo_complement.fa




  • 版本
    		更新日期版本信息
    v1.1
    		2020.10.25
    		更新说明文档