fasta序列转化

开发者：huanan | 更新于1 月，1 周前 | 浏览量 176

fasta序列转化，可将fasta序列转化成以下形式：互补序列，反向序列，反向互补序列，转录序列，反转录序列以及翻译的蛋白序列；

参数可选：互补，反向，反向互补，转录，反转录，以及翻译。

输出文件名由输入文件名和转化类型决定，并以.fasta为后缀。

参数信息

相关数据

1. fasta文件格式：

（1）第一行是由“>”开始的任意文字说明，用于序列标记，为了确保后续分析软件能够区分每条序列，单个序列的标识必须具有唯一性；

（2）第二行是碱基ATCG/ATCU序列，核苷酸符号大小写均可。

示例文件：demo.fasta

1. 输出fasta序列文件：

① 参数为“互补”时，输出序列文件的碱基互补序列；

② 参数为“反向”时，输出序列文件的反向序列；

③ 参数为“反向互补”时，输出序列文件的反向碱基互补序列；

④ 参数为“转录”时，输出序列文件的转录序列；

⑤ 参数为“反转录”时，输出序列文件的逆转录序列；

⑥ 参数为“翻译”时，输出序列文件的翻译序列。