fasta序列转化

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为fasta序列转化,可将fasta序列转化成以下形式:互补序列,反向序列,反向互补序列,转录序列,反转录序列以及翻译的蛋白序列; 输出文件名由输入文件名和转化类型决定,并以.fasta为后缀。

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结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. fasta文件格式

  1. (1)  第一行是由“>”开始的任意文字说明,用于序列标记,为了确保后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;

  2. (2)  第二行是碱基ATCG/ATCU序列,核苷酸符号大小写均可。


demo_fa.png


    demo数据下载demo.fasta


  1. 1. 输出fasta序列文件

  1.     (1) 参数为“互补”时,输出序列文件的碱基互补序列;

  2.     (2) 参数为“反向”时,输出序列文件的反向序列;

  3.     (3) 参数为“反向互补”时,输出序列文件的反向碱基互补序列;

  4.     (4) 参数为“转录”时,输出序列文件的转录序列;

  5.     (5) 参数为“反转录”时,输出序列文件的逆转录序列;

  6.     (6) 参数为“翻译”时,输出序列文件的翻译序列。


output_fa.png


示例文件:demo_complement.fa




版本
更新日期版本信息
v1.1
2020.10.25
更新说明文档


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