fa序列长度过滤

开发者：华楠, 张婷  |  更新于2 周，6 日前  |  浏览量 74

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具从上传的序列文件中筛选出特定长度范围内的序列。
输出文件名由输入文件名决定，并以.fasta为后缀。

参数信息
  1. 输入文件为fasta格式，文件大小不能超过200M
  2. 设置要筛选出的序列最小长度，如果文件中序列长度小于该值，该序列将被过滤

查看更多非必选参数

  1. 设置要筛选出的序列最大长度（可不填），如果文件中序列长度大于该值，该序列将被过滤
相关数据
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  • 结果说明
  • 重要提示
  • 版本信息

    1. 1. 输入fasta序列文件

    1. （1）第一行是由“>”开始的任意文字说明，用于序列标记，为了确保后续分析软件能够区分每条序列，单个序列的标识必须具有唯一性；

    2. （2）第二行是碱基ATCG/ATCU序列，核苷酸符号大小写均可。



    filter_fa.png



        demo数据下载：demo.fasta



    1. 1. 结果示例1

        输出长度范围内的fasta序列；示例中最小长度为200，最大长度为800。


    an1.png


    1. 2. 结果示例2

        输出长度范围内的fasta序列；示例中最小长度为200，最大长度不限。


    an2.png


    1. (1) 输入序列文件必须为fasta格式文件；

  • 版本
    		更新日期版本信息
    v1.1
    		2020.10.25
    		更新说明文档