fa序列长度过滤

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具从上传的序列文件中筛选出特定长度范围内的序列。 输出文件名由输入文件名决定,并以.fasta为后缀。

参数调整

输入文件为fasta格式,文件大小不能超过200M
设置要筛选出的序列最小长度,如果文件中序列长度小于该值,该序列将被过滤
设置要筛选出的序列最大长度(可不填),如果文件中序列长度大于该值,该序列将被过滤
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结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. 输入fasta序列文件

  1. (1)第一行是由“>”开始的任意文字说明,用于序列标记,为了确保后续分析软件能够区分每条序列,单个序列的标识必须具有唯一性;

  2. (2)第二行是碱基ATCG/ATCU序列,核苷酸符号大小写均可。



filter_fa.png



    demo数据下载:demo.fasta



  1. 1. 结果示例1

    输出长度范围内的fasta序列;示例中最小长度为200,最大长度为800


an1.png


  1. 2. 结果示例2

    输出长度范围内的fasta序列;示例中最小长度为200,最大长度不限。


an2.png


  1. (1) 输入序列文件必须为fasta格式文件;

版本
更新日期版本信息
v1.1
2020.10.25
更新说明文档


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