文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具用于结合分组信息对PCR结果的Ct值表进行定量计算。
任务正在排队中,目前后台任务排队数量:
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程序运行出错,报错信息如下:
1. 输入Ct值表格(必须是xlsx格式)
输入的ct值表示例如图1,第一列为"样本",第二列为"分组"(注意前两列列名的首字母大写)后面列为各基因的Ct值。注意:这里的gene0为内参基因,在计算时会基于此基因做标准化。
图1 Ct值表
demo数据下载:Ct.xlsx
2. 样品分组表格
分别填入对照组和实验组名(注意列名的首字母大写)
注:第一列为对照组,第二列为实验组
图2 分组表格
demo数据下载:diff_group.xlsx
1. 文件夹第一层
该层包括各比较组的结果,Ct均值表,ΔCt值表。
图1 结果文件夹第一层示例图
2. 文件夹第二层
该层包括比较组定量结果表格和柱状图,其中“tmp”文件为计算中间步骤值表格。
图2 结果文件夹第二层示例图
图3 实验与对照的定量结果示例图
(1) Ct表必须为xlsx格式,数据格式请参考使用说明;
(2) 样品分组表格第一列为对照组,第二列为实验组;
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
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旧v2.8 | 2020.10.25 | 修复中文绘图异常 |
v1.0.0 | 2023.04.27 | 释放误差线宽度参数 |