靶标预测

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具使用miranda软件预测靶标关系。

参数调整

上传miRNA序列。文件名请不要包含空格, ()等特殊字符
序列条数不能超过100，总长度不能超过10W。文件名请不要包含空格, ()等特殊字符
对结果进行命名用于区分不同的任务，默认为当前工具名称_当前日期时间
通常选择-10到-30，数值越小越严格
通常选择140/150，数值越大越严格
miRNA种子区域是否需要严格匹配
 提交 重置

结果与说明

任务正在排队中，目前后台任务排队数量:

当前任务开始运行后预计需要耗时

请勿重复提交任务!

程序正在运行中，预计需要耗时

{{ m.content }}

程序运行出错，报错信息如下：

    1. miRNA序列示例文件



miRNA_fa.png


demo数据下载：miRNA.fa


    2. 靶向RNA(mRNA)序列示例文件


targetRNA_fa.png


    demo数据下载：mRNA.fa



  【demo文件压缩包下载：示例序列文件.zip】

    1. "mirna_target_raw.txt"

        靶标的详细信息，包括结合位点示意、结合分数、结合自由能等。

    

    2. "mirna_target_Result.csv"

        靶标结合表格结果表头解释

表头
解释
miRNAmiRNA的ID
Target靶RNA的ID
Total Score总的结合分数
Total Energy总的自由能
Max Score最大结合分数
Max Energy最大自由能
miRNA LengthmiRNA的长度
Target Length靶RNA的长度
PositionsmiRNA在靶RNA上的结合位点

    (1) 本工具程序接收miRNA，靶向mRNA(mRNA/lncRNA/circRNA)的fa格式序列文件；
版本
使用说明版本信息
v1.1
2020.10.25
更新说明文档
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