文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具使用miranda软件预测靶标关系。
任务正在排队中,目前后台任务排队数量:
当前任务开始运行后预计需要耗时
请勿重复提交任务!程序正在运行中,预计需要耗时
程序运行出错,报错信息如下:
1. miRNA序列示例文件
demo数据下载:miRNA.fa
2. 靶向RNA(mRNA)序列示例文件
demo数据下载:mRNA.fa
【demo文件压缩包下载:示例序列文件.zip】
1. "mirna_target_raw.txt"
靶标的详细信息,包括结合位点示意、结合分数、结合自由能等。
2. "mirna_target_Result.csv"
靶标结合表格结果表头解释
表头 | 解释 |
miRNA | miRNA的ID |
Target | 靶RNA的ID |
Total Score | 总的结合分数 |
Total Energy | 总的自由能 |
Max Score | 最大结合分数 |
Max Energy | 最大自由能 |
miRNA Length | miRNA的长度 |
Target Length | 靶RNA的长度 |
Positions | miRNA在靶RNA上的结合位点 |
(1) 本工具程序接收miRNA,靶向mRNA(mRNA/lncRNA/circRNA)的fa格式序列文件;
版本 | 使用说明 | 版本信息 |
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v1.1 | 2020.10.25 | 更新说明文档 |