微生物&代谢组学分析
微生物&代谢组学分析通过将微生物数据与代谢数据进行综合了考量，旨在找出关键性Biomarker，提示样本间关系，揭示内在的生物学意义。
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程序运行出错，报错信息如下：
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1、代谢组报告文件
1）代谢物数据矩阵表，请参考代谢组学报告文件：《3.数据矩阵/数据矩阵.xlsx》，
必须包含代谢物和各样本的测量值。
| Metabolites | MFA1 | MFA2 | MFA3 | MFA4 |
| PE(16:0/0:0) | 85981 | 242235 | 115372 | 1501664 |
| 4-Pyridoxic acid | 231132 | 2011106 | 91220 | 203297 |
| LysoPC(0:0/16:0) | 201843 | 128615 | 3100375 | 254147 |
| LysoPE(15:0/0:0) | 2260049 | 1974154 | 5377 | 8578 |
| L-Histidine | 138772 | 58492 | 37146 | 8249 |
| Etretinate | 76268 | 62754 | 9425 | 2682 |
demo示例数据：
数据矩阵.xlsx
2）差异代谢物表，请参考代谢组学报告文件：《6.差异代谢物/差异代谢物.xlsx》
必须包含代谢物和各样本的测量值。
| Metabolites | MFA1 | MFA2 | MFA3 | MFA4 |
| 3b,7a-Dihydroxy-5b-cholanoic acid | 61514292 | 47073462 | 53671009 | 419440 |
| Norvaline | 71275 | 7430179 | 9365159 | 1213620 |
| L-Proline | 600339 | 2981209 | 5088250 | 5200210 |
| 17-HOME(9Z) | 144051 | 2236422 | 694413 | 144023 |
demo示例数据：差异代谢物.xlsx
2、微生物组报告文件
微生物丰度水平文件，为多个level的目录压缩文件，并以对应水平的英文名称命名，如16S项目报告中：《result\3.Community_Structure\abundance\relative_abundance\genus（phylum、class、order、family、species）.xls》文件
必须包含微生物biomarker和各样本的相对丰度值。
| Taxonomy | MFA1 | MFA2 | MFA3 | MFA4 |
| Bacteroides | 0.58722 | 0.71112 | 0.47397 | 0.67070 |
| Faecalibacterium | 0.00561 | 0.00591 | 0.01687 | 0.007514 |
| Fusobacterium | 0.11330 | 0.084678 | 0.11077 | 0.07166 |
| Lactobacillus | 0.00574 | 0.01115 | 0.01156 | 0.03093 |
demo示例：
test_micro.zip
3、对应关系分组表
分组表有两个sheet表，分别为组学分析表和分组分析表，表头和sheet名称固定，否则报错。
1）组学分析表
第一列为微生物样本，第二列为代谢物样本，第三列为通用样本名称，微生物和代谢物样本一一对应。第四列为微生物样本对应的分组名称，第五列为代谢物样本对应的分组名称，第六列为微生物和代谢物样本的分组统一名称，请一一对应。
注意：这里选择的样本必须与上传的微生物和代谢物的表格中的一致，并且微生物和代谢物的样本对应关系应是一致的，统一的样本名称和分组名称可以自由命名，一般是字母+数字即可。
| omics1sample | omics2sample | label | omics1group | omics2group | groupname |
| MFA1 | MFA1 | MFA1 | MFA1 | MFA | MFA |
| MFA2 | MFA2 | MFA2 | MFA2 | MFA | MFA |
| MFA3 | MFA3 | MFA3 | MFA3 | MFA | MFA |
| MFA4 | MFA4 | MFA4 | MFA4 | MFA | MFA |
| MFAP1 | MFAP1 | MFAP1 | MFAP1 | MFAP | MFAP |
| MFAP2 | MFAP2 | MFAP2 | MFAP2 | MFAP | MFAP |
| MFAP3 | MFAP3 | MFAP3 | MFAP3 | MFAP | MFAP |
| MFAP4 | MFAP4 | MFAP4 | MFAP4 | MFAP | MFAP |
| MFP1 | MFP1 | MFP1 | MFP1 | MFP | MFP |
| MFP2 | MFP2 | MFP2 | MFP2 | MFP | MFP |
| MFP3 | MFP3 | MFP3 | MFP3 | MFP | MFP |
| MFP4 | MFP4 | MFP4 | MFP4 | MFP | MFP |
| M3 | M3 | M3 | MS | MS | MS |
| M4 | M4 | M4 | MS | MS | MS |
| M5 | M5 | M5 | MS | MS | MS |
| M6 | M6 | M6 | MS | MS | MS |
| NC1 | NC1 | NC1 | NC1 | NC | NC |
| NC2 | NC2 | NC2 | NC2 | NC | NC |
| NC3 | NC3 | NC3 | NC3 | NC | NC |
| NC4 | NC4 | NC4 | NC4 | NC | NC |
| PC1 | PC1 | PC1 | PC1 | PC | PC |
| PC2 | PC2 | PC2 | PC2 | PC | PC |
| PC3 | PC3 | PC3 | PC3 | PC | PC |
| PC4 | PC4 | PC4 | PC4 | PC | PC |
2）分组分析表
此表为两两分组比较的关系表，要对哪些分组进行两两比较，注意要与代谢组的分组一致，否则会报错。
| 分组1 | 分组2 |
| MS | NC |
| PC | NC |
| MFA | NC |
| MFP | NC |
| MFAP | NC |
demo示例数据：group2.xlsx
结果文件说明
| 第一层级 | 第二层级 | 第三层级 | 表示含义 |
| phylum | -- | -- | 分析level结果文件夹 |
| 1.多组学维度评估样本分组 | -- | 所有样本降维分析结果 | |
| 2.重要性变量分析-biomarker筛选 | -- | 所有样本biomarker筛选结果 | |
| 3.功能分析 | 分组1_分组2/1.correlation | 当前分组相关性分析结果文件 | |
| report_分组1_分组2.html | -- | 当前分组报告结果文件 |
1、分析流程图
