气泡图,用于展示富集分析结果中P值最小的前N个功能或者通路。其中Y轴对应功能或者通路,X轴表示特定通路中的差异基因和通路中所有基因的比值,气泡的大小表示该通路中差异基因的多少,气泡颜色由紫-蓝-绿-红变化,其富集 pValue 值越小,显著程度越大。 通过气泡图,可以生动地展示富集分析结果中的各个关键统计量,从而在一张图上呈现更多的信息。 富集结果的呈现也有利用条形图来展示的。
气泡图,用于展示富集分析结果中P值最小的前N个功能或者通路。其中Y轴对应功能或者通路,X轴表示特定通路中的差异基因和通路中所有基因的比值,气泡的大小表示该通路中差异基因的多少,气泡颜色由紫-蓝-绿-红变化,其富集 pValue 值越小,显著程度越大。
通过气泡图,可以生动地展示富集分析结果中的各个关键统计量,从而在一张图上呈现更多的信息。
富集结果的呈现也有利用条形图来展示的。
1. 输入数据:
输入表格需包含中"Term_description”、“ListHit”、“Enrichment_score”和“P_value”列。【文件格式支持:txt,csv,xlsx,xls】
输入表格示例
注:推荐使用芯片报告中富集结果原文件,或对原文件中GO或KEGG条目进行删减(挑选)后的文件
示例文件下载:demo_bubble_data.xlsx
1. 气泡图
示例图中Y轴对应功能或者通路的名称;X轴对应特定通路中差异基因与该通路所包含的所有基因的比值,值越大,说明该通路的差异基因占比越高;气泡图上的点表示差异基因的多少,点越大,特定通路中的差异基因越多;