文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 基因表达箱线图统计每个样本表达量中的5个值:最小值、第一四分位数(25%)、中位数(50%)、第三四分位数(75%)和最大值,可以粗略地看出数据分布的分散程度等信息。
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程序运行出错,报错信息如下:
请检查数据文件格式后重新提交运行
本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!
1. 表达量矩阵文件
第一列为基因/蛋白/代谢物名称,其余各列为各样品中相应表达量。
demo数据下载:fpkm.xls
2. 样本分组信息文件(非必选)
第一列为样本分析名称"Sample", 与表达量矩阵列名保持一致,第二列为分组名称"Group"。
demo数据下载:group.xls
1. 图形输出
横轴为样本名称,纵轴为 log10(FPKM+1),每个区域的盒形图对应五个统计量(至上而下分别为最大值,第三四分位数,中值,第一四分位数和最小值)
2. 表格输出
从左到右分别为最小值,第一四分位数,中值,第三四分位数,最大值,标准差和总和。
1) 除了使用报告中5.additional文件夹下fpkm.xls文件,也可以自行根据5.additional文件夹下counts.xls文件用其他标准化方法(fpm,tpm)生成矩阵表达文件绘制箱线图。
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
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v0.01 | 2021.3.24 | 基因表达箱线图上线 |
v0.02 | 2021.6.1 | 添加字体类型和字体样式参数 |