文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 基于miranda序列匹配画图:使用miRNA和靶基因序列进行结合位点绘制,更加直观的显示miRNA与靶基因的结合信息。 1、输入的数据格式必须为fasta格式; 2、仅适用于一对一的序列关系; 3、输出图片格式:png
工具预估运行时间为 {{ run_time }} 秒
程序运行出错,报错信息如下:
请检查数据文件格式后重新提交运行
本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!
输入文件1和2皆为fasta格式:*.fa(或*.fasta)
1、第一行以‘>’开头的序列id,为了进行区分,请保证两个输入文件的id的唯一性;
2、第二行开始,是碱基序列。
demo数据下载:circRNA.fa miRNA.fa
分析结果:
1、结合位点图片;
2、"mirna_target_raw.txt"和 "mirna_target_Result.csv"文件
靶标的详细信息和结果文件
结果图片示例:*.png
1、请确保输入的序列文件中miRNA和targetRNA(circRNA或lncRNA)有且仅有一个;
2、确认输入文件格式是否正确(以‘>’开头),具体格式参考使用说明。
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
v1.0 | 2020.11.19 | 使用miranda结果文件进行绘图。 |
v2.0 | 2021.02.22 | 使用fasta序列进行绘图,暂时仅支持进行一对一绘图。 |
v3.0 | 2021.05.24 | 添加重要提示,完善报错信息 |