富集结果添加基因信息

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具针对富集结果添加各条目对应基因的信息(上下调,差异倍数,表达情况等)

参数调整

通常为GeneSymbols或Gene
通常为GeneSymbols或gene_id
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结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. 富集结果输入文件

enrich_table.png

    测序项目中富集结果文件名称为"enrichment-*xls"

    芯片项目中富集结果文件名称为"*_enrichment_result.csv"

    

    demo数据下载enrichment-kegg-Case-vs-Con-Total.xls



  1. 2. 差异基因输入文件

    diff_table.png

    测序项目中差异结果文件名称为"*diff-pval-*-FC*.gene.xls"

    芯片项目中差异结果文件名称为"comp*_vs_*FC*.csv"

    

    demo数据下载:Case-vs-Con-diff-pval-0.05-FC-2.gene.xls



  1. 1. 结果说明

图片3.png    

merge_res.png

    结果文件:

    针对每个条目输出一个单独的文件,条目中有斜杠的输出自动转换为下划线“_”;以及所有条目的汇总文件(all_results)。


  1. (1) 本工具只接收欧易生物出具的测序、芯片的差异表格结果和GO/KEGG富集结果;


  2. (2) 外来数据格式不兼容时,请使用本工具前,按照输入示例文件格式对数据进行修改;


版本
更新日期更新内容
v1.1
2020.10.25
更新说明文档





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