富集结果添加基因信息

开发者:oebiotech  |  更新于3 周,3 日前  |  浏览量 84

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具针对富集结果添加各条目对应基因的信息(上下调,差异倍数,表达情况等)

参数信息
  1. 通常为GeneSymbols或Gene
  2. 通常为GeneSymbols或gene_id
相关数据
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    1. 1. 富集结果输入文件

    enrich_table.png

        测序项目中富集结果文件名称为"enrichment-*xls"

        芯片项目中富集结果文件名称为"*_enrichment_result.csv"

        

        demo数据下载enrichment-kegg-Case-vs-Con-Total.xls



    1. 2. 差异基因输入文件

        diff_table.png

        测序项目中差异结果文件名称为"*diff-pval-*-FC*.gene.xls"

        芯片项目中差异结果文件名称为"comp*_vs_*FC*.csv"

        

        demo数据下载:Case-vs-Con-diff-pval-0.05-FC-2.gene.xls



    1. 1. 结果说明

    图片3.png    

    merge_res.png

        结果文件:

        针对每个条目输出一个单独的文件,条目中有斜杠的输出自动转换为下划线“_”;以及所有条目的汇总文件(all_results)。


    1. (1) 本工具只接收欧易生物出具的测序、芯片的差异表格结果和GO/KEGG富集结果;


    2. (2) 外来数据格式不兼容时,请使用本工具前,按照输入示例文件格式对数据进行修改;


  • 版本
    更新日期更新内容
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档





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