miRNA靶标预测

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。 使用miRDB和miRWalk两个miRNA靶基因预测数据库,根据指定的人、小鼠、大鼠miRNA_id预测靶基因。

参数调整

第一列为miRNA id
选择“miRDB & miRWalk 数据库”时勾选
提交 重置

结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. 文本框输入

    输入一列miRNA_id(人、小鼠、大鼠)



miRNA_input.png


    demo数据下载(物种:人):miRNA靶标预测.xls






  1. 1. 结果说明

    1)分析网页版报告

        target_result.html    


    2)miRDB & miRWalk 交集Venn图

    b8ea7ae255b0____miRWalk∩miRDB_venn.png


    3)预测结果表头解释

表头解释说明
miRNA_v22miRNA的ID
EntrezGeneID靶基因的EntrezGeneID
GeneSymbol靶基因的GeneSymbol
miRDB_mRNA靶基因在miRDB数据库中的转录本ID
miRDB_ScoremiRDB数据库中的靶标结合打分
miRWalk_mRNA靶基因在miRWalk_数据库中的转录本ID
miRWalk_BindingSitesmiRWalk数据库中的靶标结合位点






  1. (1) miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的



版本
更新日期更新内容
v1.1
2020.10.27
更新说明文档
v1.2
2022.02.28
bug修复





问题反馈