miRNA靶标预测

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。
使用miRDB和miRWalk两个miRNA靶基因预测数据库，根据指定的人、小鼠、大鼠miRNA_id预测靶基因。

参数调整

第一列为miRNA id
对结果进行命名用于区分不同的任务，默认为当前工具名称_当前日期时间
选择“miRDB & miRWalk 数据库”时勾选
 提交 重置

结果与说明

任务正在排队中，目前后台任务排队数量:

当前任务开始运行后预计需要耗时

请勿重复提交任务!

程序正在运行中，预计需要耗时

{{ m.content }}

程序运行出错，报错信息如下：

    1. 文本框输入

    输入一列miRNA_id(人、小鼠、大鼠)。



miRNA_input.png


    demo数据下载（物种：人）：miRNA靶标预测.xls

    1. 结果说明

    1）分析网页版报告

        target_result.html    


    2）miRDB & miRWalk 交集Venn图

    b8ea7ae255b0____miRWalk∩miRDB_venn.png


    3）预测结果表头解释

表头解释说明
miRNA_v22miRNA的ID
EntrezGeneID靶基因的EntrezGeneID
GeneSymbol靶基因的GeneSymbol
miRDB_mRNA靶基因在miRDB数据库中的转录本ID
miRDB_ScoremiRDB数据库中的靶标结合打分
miRWalk_mRNA靶基因在miRWalk_数据库中的转录本ID
miRWalk_BindingSitesmiRWalk数据库中的靶标结合位点

    (1) miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的；
版本
更新日期更新内容
v1.1
2020.10.27
更新说明文档
v1.2
2022.02.28
bug修复
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