miRNA靶标预测

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开发者:xts  |  更新于1 月,3 周前  |  浏览量 900

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。
使用miRDB和miRWalk两个miRNA靶基因预测数据库,根据指定的人、小鼠、大鼠miRNA_id预测靶基因。

参数信息
  1. 第一列为miRNA id

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    选择“miRDB & miRWalk 数据库”时勾选
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    1. 1. 文本框输入

        输入一列miRNA_id(人、小鼠、大鼠)



    miRNA_input.png


        demo数据下载(物种:人):miRNA靶标预测.xls






    1. 1. 结果说明

        1)分析网页版报告

            target_result.html    


        2)miRDB & miRWalk 交集Venn图

        b8ea7ae255b0____miRWalk∩miRDB_venn.png


        3)预测结果表头解释

    表头解释说明
    miRNA_v22miRNA的ID
    EntrezGeneID靶基因的EntrezGeneID
    GeneSymbol靶基因的GeneSymbol
    miRDB_mRNA靶基因在miRDB数据库中的转录本ID
    miRDB_ScoremiRDB数据库中的靶标结合打分
    miRWalk_mRNA靶基因在miRWalk_数据库中的转录本ID
    miRWalk_BindingSitesmiRWalk数据库中的靶标结合位点






    1. (1) miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的



  • 版本
    更新日期更新内容
    v1.1
    2020.10.27
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