miRNA靶标预测

开发者：xtsheng  |  更新于23 小时，28 分钟前  |  浏览量 200

本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。
使用miRDB和miRWalk两个miRNA靶基因预测数据库，根据指定的人、小鼠、大鼠miRNA_id预测靶基因。

参数信息
  1. 第一列为miRNA id

查看更多非必选参数

    选择“miRDB & miRWalk 数据库”时勾选
相关数据
  • 使用说明
  • 结果说明
  • 重要提示
  • 版本信息

    1. 1. 输入文件

        输入文件第一列的miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的，其他列的信息可以不提供。

    miRNA_table1.png

        

    1. 2. 文本框输入

        输入一列miRNA_id。

    miRNA_input.png


        demo数据下载（物种：人）：miRNA靶标预测.xls





    1. 1. 结果说明

        结果表头解释

    表头解释说明
    miRNA_v22miRNA的ID
    EntrezGeneID靶基因的EntrezGeneID
    GeneSymbol靶基因的GeneSymbol
    miRDB_mRNA靶基因在miRDB数据库中的转录本ID
    miRDB_ScoremiRDB数据库中的靶标结合打分
    miRWalk_mRNA靶基因在miRWalk_数据库中的转录本ID
    miRWalk_BindingSitesmiRWalk数据库中的靶标结合位点






    1. (1) miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的；



  • 版本
    		更新日期更新内容
    v1.1
    		2020.10.27
    		更新说明文档