文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为miRNA靶标预测(基于miRDB和miRWalk数据库)。 使用miRDB和miRWalk两个miRNA靶基因预测数据库,根据指定的人、小鼠、大鼠miRNA_id预测靶基因。
工具预估运行时间为 {{ run_time }} 秒
程序运行出错,报错信息如下:
请检查数据文件格式后重新提交运行
本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!
1. 文本框输入
输入一列miRNA_id(人、小鼠、大鼠)。
demo数据下载(物种:人):miRNA靶标预测.xls
1. 结果说明
1)分析网页版报告
target_result.html
2)miRDB & miRWalk 交集Venn图
3)预测结果表头解释
表头 | 解释说明 |
miRNA_v22 | miRNA的ID |
EntrezGeneID | 靶基因的EntrezGeneID |
GeneSymbol | 靶基因的GeneSymbol |
miRDB_mRNA | 靶基因在miRDB数据库中的转录本ID |
miRDB_Score | miRDB数据库中的靶标结合打分 |
miRWalk_mRNA | 靶基因在miRWalk_数据库中的转录本ID |
miRWalk_BindingSites | miRWalk数据库中的靶标结合位点 |
(1) miRNA_id(人、小鼠、大鼠)是必需的;
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
---|---|---|
v1.1 | 2020.10.27 | 更新说明文档 |
v1.2 | 2022.02.28 | bug修复 |