Violin

开发者:wyl  |  更新于1 月前  |  浏览量 36

小提琴图 (Violin Plot)是用来展示多组数据的分布状态以及概率密度。这种图表结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。跟箱形图类似,但是在密度层面展示更好。在数据量非常大不方便一个一个展示的时候小提琴图特别适用。

本工具用于微生物多样性 alpha 指数Violin分析,适用于组别为2组及以上,组内有生物学重复的数据集。

参数信息
  1. alpha指数矩阵文件,列为样本指数值,行为alpha稀释步长。
  2. 样本分组信息文件,第一列为样本分析名,与OTU丰度文件中的样本分析名一致,第二列为分组名
    组别个数小于等与5组填写Wilcoxon,否则填写kruskal-wallis
相关数据
  • 结果说明
  • alpha 指数文件
  • 版本信息
  • 1. Violin结果示意图

        图展示多样性指数在各个组的分布情况,以及多样性指数在组间差异是否显著(如果组内无重复样则不能分析),其中横坐标为分组,不同组用不同颜色区分,纵坐标为指数值。在上图中,白点是中位数,白色盒型的范围是下四分位点到上四分位点,细黑线表示须。注;五组以下标记ns为无差异。

    violin.png

  • 1. alpha 指数文件

        alpha 指数矩阵文件(tab分割文件),列为样本指数值,行为alpha稀释步长。

    alpha.png

        示例数据:alpha.xls


    2. 样本分组信息文件

        样本分组信息文件(tab分割文件),第一列为样本分析名需要与alpha 指数矩阵文件中的样本分析名一致,第二列为分组名。

    mapping.png

        示例数据:mapping.xls


  • 版本
    更新日期
    更新内容
    v1.1
    2020.10.25
    更新说明文档