表达量点线图

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.com.
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本工具根据所提供的基因表达量数据,进行可视化分析,以便快速阅读关注基因的表达水平变化规律。

参数调整

基因表达量矩阵文件,请参考表达量示例文件
对结果进行命名用于区分不同的任务,默认为当前工具名称_当前日期时间
是否对数据进行预处理,默认 log2
自定义横坐标标题,默认 "Sample"
自定义纵坐标标题,默认 "Expression"(若数据就行标准化处理,则为“log2 Expression”)
图片高度,可调整 (默认 8);取值范围:1-199
图片宽度,可调整 (默认 12);取值范围:1-199
字体类型,默认"Arial"
字体样式,默认"无"
提交 重置

结果与说明

任务正在排队中,目前后台任务排队数量:

当前任务开始运行后预计需要耗时

请勿重复提交任务!

程序正在运行中,预计需要耗时

{{ m.content }}

程序运行出错,报错信息如下:

1. 输入矩阵文件

    第一列为基因或转录本名称,其余各列为各样品中相应基因或转录本的表达量 FPKM 值。


fpkm.png

    demo数据下载:fpkm.3rep.xls


1. 图形输出

    示例图片为默认参数下的表达量点线图。


point_line.oebiotech.png


    (1) 展示特征不宜过多;

版本更新日期更新内容
v1.52020.06.10修复输入格式问题
v1.9.12020.10.25添加数据预处理,横纵坐标,画布长宽,图片格式参数
v2.1.32020.11.13针对目前所遇到的文件格式错误制定报错机制
v2.1.42020.12.11添加字体参数, 判断编码方式, 修改遍历数据类型的bug
v2.1.5
2020.12.26
判断编码方式优化, 空数据矩阵检查, 非负数进行log化抛出报错
v2.3.0
2021.01.22
报错日志oeweb_task.log
V1.012021.03.07画布高宽限制为正数
v1.452023.02.03y轴标题bug,报错抛出语句优化
v1.722023.05.16数据处理、抛出语句优化


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