表达量点线图

开发者：范美婷, 张志康  |  更新于2 周，6 日前  |  浏览量 242

文献引用：Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn.
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本工具根据所提供的基因表达量数据，进行可视化分析，以便快速阅读关注基因的表达水平变化规律。

参数信息
  1. 基因表达量矩阵文件，请参考表达量示例文件

查看更多非必选参数

    是否对数据进行预处理，默认 log2
  2. 自定义横坐标标题，默认 "Sample"
  3. 自定义纵坐标标题，默认 "log2 Expression"
  5. 图片高度，可调整 (默认 8)；取值范围：1-199
  6. 图片宽度，可调整 (默认 12)；取值范围：1-199
    字体类型，默认"Arial"
    字体样式，默认"无"
相关数据
  • 使用说明
  • 结果说明
  • 重要提示
  • 版本信息

    1. 1. 输入矩阵文件

        第一列为基因或转录本名称，其余各列为各样品中相应基因或转录本的表达量 FPKM 值。


    fpkm.png


        demo数据下载：fpkm.3rep.xls


    1. 1. 图形输出

        示例图片为默认参数下的表达量点线图。


    point_line.oebiotech.png


    1. (1) 展示特征不宜过多；

  • 版本更新日期更新内容
    v1.52020.06.10修复输入格式问题
    v1.9.12020.10.25添加数据预处理，横纵坐标，画布长宽，图片格式参数
    v2.1.32020.11.13针对目前所遇到的文件格式错误制定报错机制
    v2.1.42020.12.11添加字体参数, 判断编码方式, 修改遍历数据类型的bug
    v2.1.5
    		2020.12.26
    		判断编码方式优化, 空数据矩阵检查, 非负数进行log化抛出报错
    v2.3.0
    		2021.01.22
    		报错日志oeweb_task.log
    V1.012021.03.07画布高宽限制为正数