文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为绘制双饼环图,可以分别展示蛋白和基因层面在不同GO分类中的占比,了解生物学过程(BP)、细胞组成(CC)和分子功能(MF)三大功能中转录和蛋白所占条目比例。
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程序运行出错,报错信息如下:
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本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!
1. 转录/蛋白输入文件
第一列(#GO_classify1):GO分类的第一层级(包括biological process,cellular component,molecular function),每一层级的条目不得少于2个。
第二列(#GO_classify2):所属第一层级的GO条目。
第三列(Unigene) :检测基因的数目(或占比),如果没有,可用0补充,此列要与第五列对应。
第四列(diff-Total) :差异基因总数(或占比),此列要与第六列对应。
第五列(Unigene) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。
第六列Gene(diff-Total) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。
demo数据下载:ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.mRNA.xls
demo数据下载:ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.protein.xls
1. GO双饼环图示例结果
图中不同颜色为Biological Process层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。
图中不同颜色为Cellular Component层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。
图中不同颜色为Molecular Function层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。
(1) 外来数据格式不兼容时,请使用本工具前,按照输入示例文件格式对数据进行修改;
版本 | 更新日期 | 更新内容 |
---|---|---|
v1.0 | 2020.10.25 | 更新说明文档 |
v1.1 | 2021.06.20 | 解决输入文件读取问题,增加字体、字型参数 |