GO双饼环图

文献引用:Bioinformatic analysis was performed using the OECloud tools at https://cloud.oebiotech.cn. -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为绘制双饼环图,可以分别展示蛋白和基因层面在不同GO分类中的占比,了解生物学过程(BP)、细胞组成(CC)和分子功能(MF)三大功能中转录和蛋白所占条目比例。

参数调整

转录组中所有基因和差异表达基因GOlevel2条目统计 (ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.mRNA.xls)
蛋白组中所有蛋白和差异表达蛋白GOlevel2条目统计 (ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.protein.xls)
字体类型,默认"Arial"
字体样式,默认"无"
提交 重置

结果与说明

工具预估运行时间为 {{ run_time }}

程序运行出错,报错信息如下:

请检查数据文件格式后重新提交运行

结果下载

本次分析未能正常生成结果文件,请核对输入信息或者参考使用说明进行使用!

  1. 1. 转录/蛋白输入文件

    第一列(#GO_classify1):GO分类的第一层级(包括biological process,cellular component,molecular function),每一层级的条目不得少于2个。

    第二列(#GO_classify2):所属第一层级的GO条目。

    第三列(Unigene) :检测基因的数目(或占比),如果没有,可用0补充,此列要与第五列对应。

    第四列(diff-Total) :差异基因总数(或占比),此列要与第六列对应。

    第五列(Unigene) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。

    第六列Gene(diff-Total) :检测基因的具体名称(若第三列数目为0,则该列用--表示)。



pie.png


    demo数据下载:ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.mRNA.xls

    demo数据下载:ALL_vs_DEG.GO.level2.stat.protein.xls



  1. 1. GO双饼环图示例结果

    图中不同颜色为Biological Process层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


biological_process.png


    图中不同颜色为Cellular Component层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


cellular_component.png


    图中不同颜色为Molecular Function层级 各个GO 条目的占比,其中,外环为mRNA的分布,内环为蛋白的分布。


molecular_function.png


  1. (1) 外来数据格式不兼容时,请使用本工具前,按照输入示例文件格式对数据进行修改;

版本
更新日期更新内容
v1.0
2020.10.25
更新说明文档
v1.12021.06.20解决输入文件读取问题,增加字体、字型参数






问题反馈