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富集基因占比条形图 9 查看 本工具主要针对富集结果,基于当前的ListHits和ListTotal数据,统计当前的基因占比情况并绘制基因占比条形图。 单因素相关性网络分析 38 查看 此工具用于展示单一组学(如基因、蛋白、微生物菌株)内分子间统计相关性,揭示潜在关联模块与关键节点,并可对关键节点注释和分类。 折线图 27 查看 -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 本工具为折线图,用于展示关注的Feature在不同比较组(仅支持3组)中的相对表达丰度的变化趋势 微生物桑基图 123 查看 此工具用于绘制微生物层级桑基图 九象限图 51 查看 九象限图用于展示转录组与蛋白组之间的关联关系,横坐标是转录组的差异倍数(取了log2),纵坐标是蛋白组的差异倍数(同样取了log2),横坐标上的虚线表示转录组的差异倍数阈值,纵坐标上的虚线表示的蛋白组的差异倍数阈值,阈值线外表示显著差异的基因/蛋白,阈值线内则表示非显著差异的基因/蛋白,每个点代表一个基因/蛋白。 双火山图 148 查看 此工具用于绘制双火山图,呈现两火山图中共同上调、下调或左上调右下调的基因。 彩色火山图 51 查看 彩色火山图(Volcano Plot)是一类用来展示组间差异和指定分类情况数据的图像,可以方便直观的展示两组样本间不同分类的差异表达基因/蛋白/代谢物的分布情况。 CUT&Tag和转录组学联合分析 31 查看 CUT&Tag和转录组学分析通过将CUT&Tag数据与有参转录组数据进行综合了考量,旨在找出关键性Biomarker,提示样本间关系,揭示内在的生物学意义。目前仅支持欧易的CUT&Tag和有参转录组学分析报告。 此工具为流程,需要输入CUT&Tag和转录组学的数据包,如果没有请联系销售发起售后,手动整理。 转录蛋白代谢组学联合分析 41 查看 转录&蛋白&代谢组学分析通过将转录组数据、蛋白组数据、代谢组数据两两进行联合分析,再基于两组学联合分析分结果,找出关键性Biomarker,提示样本间关系,揭示内在的生物学意义。目前仅支持欧易的转录组、蛋白组、代谢组报告结果。 此工具为流程,需要输入转录、蛋白、代谢组学的数据包,如果没有请联系销售发起售后,手动整理。 环形热图 242 查看 此工具用于在环形布局中绘制热图(heatmap) NOISeq差异分析 9 查看 本工具为差异分析,旨在找出不同样本间的差异表达情况。 利用R中的NOISeq包对各个样本的counts 数目进行TMM标准化处理, 再使用非参数噪声建模识别各基因为差异表达的概率。支持无生物学重复。 筛选标准:其一,FoldChange,即两样本中同一个基因表达水平的变化倍数;其二,Probability,预测各基因在该比较组内为差异基因的可能性。默认筛选差异的条件为 prob>0.8 且差异倍数≥2。 生存分析-Cox模型 64 查看 生存分析(Survival Analysis)是一种专注于研究事件发生时间及其影响因素的统计方法,Cox模型作为生存分析中的重要工具,是一种半参数回归模型,用于评估多个协变量对事件发生风险的影响。
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